石榴根系較淺，從土壤剖面觀察看，20~70厘米深的土層中根量大，密度大，占總根量的70%左右，0~20厘米的表土層和70厘米以下的深層土壤中根量較少，只占根總量的30%。根在土壤內的水平部位范圍較小。通常是地上部樹冠直徑的1~2倍，大量根系集中分布在樹冠內土壤中。

　　石榴根有骨干根、延伸根和吸收根。根系擴大主要靠延伸根。延伸根在土壤內分別垂直和水平伸展，以擴大根系范圍，吸收輸導水分和營養。延伸根長大后形成骨干根，延伸根在伸長過程中，其上發生大量側根，多數側根延伸性小而分枝性強。由側根上發生大量細小的分枝性強的吸收根并構成吸收根群，其主要功能是吸收水分和養分，數量遠比延伸根多，但死亡率亦比延伸根高。